Le laboratoire Musgaard utilise divers outils informatiques pour améliorer notre compréhension de la structure et de la fonction des protéines. De nombreuses protéines subissent des changements conformationnels dans le cadre de leur cycle fonctionnel et il est donc important de comprendre leur dynamique afin de comprendre leur fonction en détail. L'une des méthodes les plus utilisées en laboratoire est la simulation de la dynamique moléculaire (MD), qui permet de prédire le mouvement des protéines au niveau des détails atomiques en fonction du temps. Cela fournit un aperçu détaillé des changements de conformation des protéines, et donc de la fonction et de la modulation. La dynamique prédite peut en outre révéler des sites de liaison potentiels pour de nouveaux modulateurs, qui peuvent être développés en nouveaux médicaments. Le laboratoire s'intéresse particulièrement aux canaux ioniques à ligand, axés sur les canaux ioniques à détection d'acide et les récepteurs à la ryanodine, et collabore avec des experts expérimentaux pour la plupart des projets.
Publications sélectionnées
- Steered Molecular Dynamics Simulations Predict Conformational Stability of Glutamate Receptors; M Musgaard, PC Biggin, Journal of Chemical Information and Modeling 56 (9), 1787-1797, 2016
- Kainate receptor pore‐forming and auxiliary subunits regulate channel block by a novel mechanism; PMGE Brown, MRP Aurousseau, M Musgaard, PC Biggin, D Bowie, The Journal of physiology 594 (7), 1821-1840, 2016
- Distinct Structural Pathways Coordinate the Activation of AMPA Receptor-Auxiliary Subunit Complexes; GB Dawe, M Musgaard, MRP Aurousseau, N Nayeem, T Green, PC Biggin, D Bowie, Neuron 89 (6), 1264-1276, 2016
- Defining the structural relationship between kainate-receptor deactivation and desensitization; GB Dawe, M Musgaard, ED Andrews, BA Daniels, MRP Aurousseau, PC Biggin, D Bowie, Nature Structural and Molecular Biology 20 (9), 1054, 2013