Le but du plateau technique BCAI est d’aider les utilisateurs de nos équipements à obtenir des images et des données d’imagerie de haute qualité le plus efficacement possible.

Tout utilisateur doit se montrer compétent et responsable lorsqu'il fait usage des instruments de la plateforme technologique BCAI; pour cette raison, une formation est obligatoire pour tous les utilisateurs.

Formation

Afin de débuter le processus de formation, nous vous demandons de suivre les étapes suivantes :

  1. Lire et comprendre les politiques régissant l'utilisation de l'infrastructure de base de l'ACIA, qui sont affichées sur le site web.
  2. Avoir ses échantillons et être prêt à les imager dans la semaine qui suit la formation. Seuls les échantillons apportés par le stagiaire seront utilisés pour la session de formation, afin d'aider l'utilisateur à obtenir immédiatement des données d'imagerie avec les paramètres appropriés.
  3. Si vous n'en avez pas, vous devrez créer un compte sur le site web  Infinity website (notre plateforme de réservation).
  4. Soumettez une demande de formation sur le site d'Infinity, sous « Request Services ». Veuillez noter que vous devrez nous fournir tous les détails de votre expérience et vos plans de microscopie imminente. Si vous travaillez sous la direction d'un stagiaire senior, il peut être utile de l'avoir à proximité lorsque vous remplissez le formulaire. N'oubliez pas que l'approbation de votre superviseur (PI) peut être requise.
  5. Dès réception de votre demande de formation, un membre de l'équipe du BCAI prendra contact avec vous. La formation se déroulera en 3 phases : 1-Apprentissage autonome avec Microtutor, en regardant plusieurs vidéos et en répondant à un quizz. 2-Les travaux pratiques avec l'un des spécialistes en microscopie du BCAI seront ensuite planifiés. La formation sera menée sur l’échantillon apporté par l’utilisateur, afin de définir les paramètres les plus appropriés et permettre à l’utilisateur de débuter ses acquisitions dès la formation terminée. La formation ne sera réservée que si le futur utilisateur a ou est en cours de préparation des échantillons afin d’assurer une formation efficace et adaptée. 3-Enfin, vous assisterez à une présentation sur l'imagerie numérique (qu'est-ce qu'une image, comment faire une figure scientifiquement correcte et comment rapporter vos données dans votre matériel et vos méthodes). Pour vous aider à rédiger votre section sur le matériel et les méthodes, veuillez vous référer à cette liste de contrôle: https://doi.org/10.5281/zenodo.14977578s41592-023-01987-9 (3).pdf

Des frais de formation seront facturés. Un maximum de 2 membres du laboratoire peuvent être formés par session. La formation par de précédents utilisateurs est interdite et ne permet pas à un nouvel utilisateur d'avoir un accès indépendant aux systèmes. 

Accés

Il appartient au personnel du BCAI de déterminer si l'utilisateur possède les connaissances suffisantes pour utiliser un microscope pour obtenir un accès non supervisé.

Les utilisateurs peuvent réserver en ligne sur le site web d'Infinity Scheduler, uniquement pour les microscopes sur lesquels ils ont été formés. Pour en savoir plus sur Infinity dans notre installation principale.

L'accès aux salles de microscope est restreint. Les codes d'accès sont fournis pendant la formation.

Pour demander l'accès à notre salle de microscopie confocale, veuillez remplir ce formulaire et l'envoyer à [email protected] .

Si vous prévoyez accéder aux microscopes en dehors des heures de travail, veuillez envoyer un courriel au [email protected] pour vous assurer d'avoir tous les codes d'accès nécessaires.

Planning your experiment

We encourage you to think ahead about the following questions to help collect proper data from imaging. Read this article on the unique approach to guides the design of quantitative fluorescence microscopy experiments.

  • What is the scientific question you want to answer?
  • Where is your signal located in the cells?
  • What controls are needed to distinguish a meaningful experimental result?
  • What is the resolution you need?
  • How many dimensions? (x, y, z, t, multi-color)
  • Do you need to fix your samples or use live specimen?
  • How many fluorophores do I have to image?
  • If live imaging required, what are you expecting in terms of movements? For how long will you need to image? At what frame rate? Do you need environmental control?
  • While considering which dye or fluorescent probes to use, or how to prepare your samples check out Spectral Database resources in the useful links section of our website.
  • If you are not sure contact us to check the compatibility of your experimental design and needs with the equipment offered by the CBIA Core.

Most objectives in the CBIA core facility are corrected to work with #1.5 coverslips, 0.17mm thick, please check that this is what your lab has in stock before starting any experiments.

In general, a subset of objectives have correction collars which allow for an adjustable long working distance. Some objectives without correcting collars are built with a long working distance (LD Objectives for instance), if you require use of these objectives, for example to image through plastic culture dishes or customized device, please contact CBIA Core staff and provide the details.

Contactez-nous

Biologie cellulaire et d'acquisition d’images

Faculté de médecine
Université d'Ottawa
RGN 3171
451, chemin Smyth
Ottawa (Ontario) K1H 8M5

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Qui contacter ?

Directeur de la plateforme
John W.R. Copeland, PhD
Phone: 613-562-5800 ext. 8641

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Specialiste en Microscopy Senior et Gestionnaire de la plateforme
Chloë van Oostende-Triplet, PhD
Phone: 613-562-5800 ext. 8376

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Specialiste en Microscopy
Liyuan Wang, PhD
Phone: 613-562-5800 ext. 8983

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