La partie biologique de spectrométrie de masse John L. Holmes de l'Université d'Ottawa soutient la recherche de haute qualité et d’améliore l'expérience éducative des étudiants.

Protéomique

  • Identification de protéines dans des mélanges complexes (découverte de biomarqueurs) 
  • Analyse des modifications post-traductionnelles (phosphorylation, N-acétylation, glycosylation, etc.) 
  • Protéomique quantitative 
    • SM basée sur la méthode de marquage par isotopes stables 
    • Sans marquage (intégration/intensité des pics SM1, comptage des spectres SM2) 
  • Identification des protéines en interaction (analyse des complexes protéiques, interactions protéine-protéine) 
  • Interactions ADN-, ARN- protéines 
  • Protéomique ciblée (PRMs) 
  • Capacités de fragmentation en plusieurs étapes : HCD, CID et ETD  
  • Protéomique basée sur le niveau SM3 [étiquette de masse en tandem (TMT), étiquettes isobariques pour la quantification relative et absolue (iTRAQ), phosphoprotéomique, peptides réticulés. 

Métabolomie

  • Détermination de la masse 
  • Abondance naturelle des isotopes 
  • Caractérisation/élucidation structurelle (balayage complet et schéma de fragmentation) 
  • Quantification 
  • Métabolomique ciblée et non ciblée 
  • Interaction protéine-ligand 

Bioinformatique

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Analyse biologique

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