Plateformes transformationnelles

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Direction : Dre Lisa Walker (Hôpital d’Ottawa/Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa), Dr Jason Berard (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa)

Le Service d’examens neurocognitifs est une plateforme de l’Interconnectome cœur-cerveau (ICC) qui offre un accès centralisé à une expertise dans le domaine de la recherche et des tests neurocognitifs pour soutenir les efforts de collaboration des chercheuses et chercheurs de l’ICC. Ces services comprennent ce qui suit :

• Éducation et formation sur les résultats aux tests cognitifs
• Planification et soutien à toutes les étapes de recherche
• Choix des tests et aide procédurale
• Évaluations cognitives et neuropsychologiques à des fins de recherche
• Gestion des données, analyse et interprétation des tests
• Diffusion des connaissances

Personne-ressource  :

Jason Berard – Gestionnaire du Programme de recherche clinique

613-737-8899, poste 75078

([email protected]) 

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Direction : Dr Baptiste Lacoste (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa)

L’ICC a accès à des technologies d’imagerie optique avancée grâce au Centre de microscopie électronique à transmission (MET). 

Situé dans le pavillon Roger-Guindon de la Faculté de médecine de l’Université d’Ottawa, le Centre de microscopie électronique à transmission donne accès à des technologies exceptionnelles d’imagerie (comme le microscope JEOL JEM-1400Flash) et de traitement des tissus. 

Le Centre offre de la formation sur l’utilisation des instruments ainsi que des services complets de préparation et de traitement d’échantillons.

En savoir plus ici. 

Personne-ressource  :  Équipe du Centre de microscopie électronique à transmission ([email protected])

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Direction : Dr Michael Rudnicki (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa), Dr Theodore Perkins (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa)

Le Centre de bio-informatique d’Ottawa, qui se spécialise en séquençage de grande capacité, offre du soutien à l’analyse des données biologiques. Cette plateforme, installée à l’Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa, offre du soutien en analyse, en formation et en calcul scientifique. Les chercheuses et chercheurs de l’ICC auront de l’aide pour sécuriser le stockage des données d’imagerie numérique et améliorer la gestion des données et leur analyse multicentrique, et pour permettre l’analyse des séquences d’ARN et l’offre de formation en bio-informatique ou en gestion des données de recherche pour le personnel travaillant sur un projet particulier.

En savoir plus ici.

Personne-ressource :  Gareth Palidwor, gestionnaire du Centre de bio-informatique d’Ottawa

([email protected])

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Direction :  Dre Erin Mulvihill, Dre Katey Rayner, Dr Adam Shuhendler, Dr Ben Rotstein (Université d’Ottawa/Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa)

Le Centre d’imagerie préclinique (CIPC) du cœur et du cerveau offre une expertise et des infrastructures permettant de produire des images et de réaliser des analyses pour comprendre les principes fondamentaux de la pathogenèse des troubles neurologiques et cardiaques concomitants. Le Centre donne accès à des appareils d’IRM, d’échographie, d’imagerie optique, de radiation, d’échographie fonctionnelle et de tomographie par émission de positons. 

Les installations à la fine pointe du CIPC sont situées au pavillon Roger-Guindon de la Faculté de médecine de l’Université d’Ottawa et à l’Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa (en anglais). Le CIPC offre des services de bout en bout, notamment : conseils de spécialistes, élaboration de protocoles, génération de données pilotes, collecte de données et formation.

En savoir plus ici :

• https://www.uottawa.ca/research-innovation/preclinical-imaging-core
• https://www.ottawaheart.ca/researchers/resources-and-services/core-facilities-and-infrastructure/pre-clinical-imaging

Personne-ressource  : Équipe du Centre d’imagerie préclinique ([email protected]) 

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Direction : Dre Ruth Slack (Université d’Ottawa), Dre Katey Rayner (Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa), Dre Smitha Paul (Université d’Ottawa)

La plateforme de Chirurgie et soins vétérinaires neurologiques et cardiaques permet une gestion transparente et efficace des soins et de l’hébergement des animaux, de l’élevage, du génotypage, des processus chirurgicaux et du transfert des animaux entre les installations (pavillon Roger-Guindon et Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa), ce qui assurera l’uniformité des protocoles et des procédures opérationnelles normalisées pour toutes les études animales. Cette approche permettra de coordonner la distribution des tissus et la collecte des données par l’intermédiaire du portail de gestion des données, y compris l’information essentielle que les chercheurs et chercheuses doivent connaître pour accéder à la plateforme s’ils et elles ne collaborent pas déjà avec le projet et souhaitent le faire.

Personne-ressource  : 

• Smitha Paul ([email protected])
• Yubing Liu ([email protected]) 

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Direction :Dr Dean Fergusson (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa) 

Le Centre de méthodologie d’Ottawa de l’Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa est un chef de file de la recherche clinique au Canada depuis 17 ans. Il offre de l’expertise en méthodologie, statistiques et science de la mise en œuvre dans neuf domaines de services. Les recherches bénéficiant du soutien du Centre ont d’importantes répercussions sur des secteurs comme les soins intensifs, la médecine d’urgence, les maladies infectieuses et la santé périnatale. Les spécialistes du Centre sont des chefs de file de l’innovation dans le devis d’essais cliniques, et particulièrement les essais pragmatiques et les essais cliniques randomisés par grappes, qui évaluent les modèles de prestation de services en santé et font la promotion de pratiques de soins fondées sur les données probantes. L’équipe regroupe près de 40 scientifiques et membres du personnel de recherche.

En savoir plus ici.

Personne-ressource   : Julia Chehaiber ([email protected]) 

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Direction : Dr Bill Standford (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa), Dr Hanns Lochmuller, Dr Alex MacKenzie, Dre Ruth Slack, Dr Peter Liu (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa/Centre hospitalier pour enfants de l’est de l’Ontario/Université d’Ottawa/Institut de cardiologie de l’Université d’Ottawa)

Afin d’accroître la fidélité des modèles de maladies humaines, l’ICC contribuera à mettre au point des protocoles robustes pour la vascularisation et l’innervation des organoïdes par l’intermédiaire du Centre de recherche sur les cellules souches pluripotentes humaines (en anglais) de l’Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa. Cette plateforme fournit des modèles de maladies humaines physiologiquement conformes générés à partir de tissus prélevés sur des patients et patientes (reprogrammation des cellules souches pluripotentes induites) qui peuvent produire n’importe quel type de cellule corporelle (différenciation dirigée) ainsi que des tissus complexes (différenciation des organoïdes). Associées à notre capacité à créer efficacement des contrôles isogéniques, les cellules souches pluripotentes humaines constituent un outil extrêmement prometteur pour la recherche, la découverte de nouveaux traitements et les essais précliniques. Le Centre offre des services comme la reprogrammation, l’édition génomique, la différenciation directe et la différenciation des organoïdes. 

En savoir plus ici.

Personne-ressource  : [email protected]

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Direction : Dr Dean Fergusson (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa), Dr Manoj Lalu (Institut de recherche de l’Hôpital d’Ottawa)  

Le Bureau de la participation des patients aux activités de recherche (appelé OPERA pour Office for Patient Engagement in Research Activities) fait partie du Centre de méthodologie d’Ottawa; il s’agit du principal centre de ce genre des unités de soutien de la SRAP en Ontario. OPERA dirige les activités de soutien à la recherche et à la méthodologie de l’Hôpital d’Ottawa; son but est de favoriser la participation à la recherche clinique de la patientèle, des familles, des proches aidants et aidantes et des membres de la communauté. En partenariat avec le programme de participation des patients et patientes et des familles de l’Hôpital d’Ottawa, l’équipe d’OPERA travaille avec des équipes de recherche pour trouver des patients et patientes partenaires et offrir du soutien et des conseils tout au long du processus. En outre, OPERA soutient la recherche axée sur les patients et patientes en offrant des conseils de spécialistes, de la formation, des ressources et de la recherche méthodologique pour faire progresser le corpus de connaissances sur l’engagement de la patientèle dans la recherche. OPERA a travaillé avec des dizaines de chercheuses et chercheurs pour appuyer des projets portant sur des sujets aussi divers que le consentement préalable à la participation à une étude sur les accidents vasculaires cérébraux, les soins d’urgence en cas d’insuffisance cardiaque aiguë, les lésions cérébrales traumatiques, la fibrillation auriculaire, ainsi que le risque de cancer après un accident vasculaire cérébral cryptogénique.

En savoir plus ici.

Personne-ressource  : Julia Chehaiber ([email protected])

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Direction : Dr Jean-Claude Béïque, Dre Katalin Tôth, Dr Richard Naud (Université d’Ottawa)

La plateforme NeuroCardioIA de l’ICC a pour but de mettre en œuvre des technologies de pointe, tant matérielles qu’analytiques, pour comprendre les interactions dynamiques et bidirectionnelles entre le cœur et le cerveau. Plus précisément, la plateforme vise à produire des enregistrements multimodaux de mesures physiologiques et à concevoir des approches corollaires fondées sur l’IA pour analyser de manière significative et flexible des données multidimensionnelles à contenu dense. Ces données essentielles de physiologie et d’imagerie recueillies par le centre NeuroCardioIA seront en accès libre sur la Plateforme de données en psycho-neuro-cardiologie.

Personne-ressource  : Jean-Claude Béïque ([email protected]) 

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Responsables : Dre Katey Rayner (ICUO), Dr David Cook (Université d’Ottawa)

Cette plateforme intègre des technologies multiomiques de pointe afin de détecter les toutes premières modifications mécanistiques associées aux maladies neurologiques et cardiaques. Elle permet notamment de recourir au séquençage de l’ARN à cellule unique, à la transcriptomique spatiale, à l’ATAC-seq, à la métabolomique ainsi qu’à la protéomique ciblée et non ciblée, grâce à l’accès aux laboratoires StemCore et aux installations de recherche de l’Université d’Ottawa. L’ensemble des approches utilisées fournit un cadre complet favorisant la découverte de biomarqueurs et la cartographie des mécanismes précoces des maladies.

Personne-ressource : Gareth Palidwor, gestionnaire de la plateforme technologique de bioinformatique

[email protected]

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Responsable : Dr Alex Mackenzie (CHEO)

En combinant des techniques avancées d’analyse d’images et une étude détaillée et multidimensionnelle des cellules, cette plateforme permet aux équipes de recherche d’examiner simultanément plusieurs aspects des cellules – caractéristiques, comportements, interactions et emplacement moléculaire – afin de soutenir la découverte de médicaments à grande échelle et l’évaluation de traitements potentiels. Elle s’appuie notamment sur les ressources suivantes :

Bibliothèque de médicaments approuvés par la FDA L1300 de Selleck Chemicals (3 105 composés);

Collection sélectionnée de composés approuvés par la FDA, capables de franchir la barrière hématoencéphalique et jugés sûrs en clinique (250 composés);

Banque interne de plus de 210 000 composés pour des applications de criblage sur mesure, fondées sur des résultats de criblage antérieurs et la littérature scientifique.

Personnes-ressources : Alex Mackenzie ([email protected]), Stephen Baird ([email protected]) et Leo Gutierrez ([email protected])