Biographie
Joeselle Serrana a étudié la biologie à l'université d'État de Bulacan (B. Sc.) et à l'université De La Salle (M. Sc.) aux Philippines. Il a rejoint le Japon en 2016 pour suivre des études supérieures et a obtenu son diplôme de docteur en génie civil et environnemental en 2021 à l'École supérieure des sciences et de l'ingénierie de l'université Ehime (Graduate School of Science and Engineering in Ehime University) avec le soutien de la bourse du gouvernement japonais (MEXT). Sous la supervision du professeur Kozo Watanabe du Laboratoire d'écologie moléculaire et de santé du Centre d'études environnementales marines (Molecular Ecology and Health Laboratory of the Center for Marine Environmental Studies), sa formation d'étudiant chercheur et son travail de doctorat ont porté sur l'écologie moléculaire, plus précisément sur les applications du métabarcodage et de la métagénomique dans l'évaluation de la biodiversité et la surveillance écologique des écosystèmes d'eau douce. En 2021, il a rejoint le NorthOmics Lab de la Faculté de médecine de l'Université d'Ottawa, au Canada, en tant que stagiaire postdoctoral dans le cadre du projet TECHNOlogies for MIcrobiome Science and Engineering, soutenu par le programme CREATE (Collaborative Research and Training Experience) du CRSNG.
Expertise
- Écologie moléculaire
- Métabarcodage et métagénomique
- Écologie microbienne
Projets de recherche
Les intérêts de recherche de Joeselle au sein du laboratoire NorthOmics portent sur l'écologie microbienne, la résistance aux antimicrobiens et l'application de la multiomique, par exemple le séquençage de nouvelle génération et les approches basées sur la spectrométrie de masse, à l'analyse moléculaire de la résistance et des réponses écologiques et/ou évolutives des communautés microbiennes.
- Serrana JM, Watanabe K. Sediment-associated microbial community profiling: Sample pre-processing through sequential membrane filtration for 16S rdna amplicon sequencing. BMC Microbiology. 2020. doi:10.1101/2020.10.21.348342
- Serrana JM, Li B, Sumi T, Takemon Y, Watanabe K. Implications of taxonomic and numerical resolution on DNA metabarcoding-based inference of benthic macroinvertebrate responses to river restoration. Ecological Indicators. 2022;135:108508. doi:10.1016/j.ecolind.2021.108508
- Serrana JM, Ormenita LA, Almarinez BJ, Watanabe K, Barrion AT, Amalin DM. Life history and host plant assessment of the cacao mirid bug Helopeltis bakeri poppius (Hemiptera: Miridae). Phytoparasitica. 2021;50(1):1-12. doi:10.1007/s12600-021-00957-1
- Serrana JM, Li B, Sumi T, Takemon Y, Watanabe K. Profiling the microbial community structure and functional diversity of a dam‐regulated river undergoing gravel bar restoration. Freshwater Biology. 2021;66(11):2170-2184. doi:10.1111/fwb.13824
- Serrana JM, Miyake Y, Gamboa M, Watanabe K. Comparison of DNA metabarcoding and morphological identification for stream macroinvertebrate biodiversity assessment and monitoring. Ecological Indicators. 2019;101:963-972. doi:10.1016/j.ecolind.2019.02.008
- Serrana JM, Ishitani N, Carvajal TM, et al. Unraveling the genetic structure of the coconut scale insect pest (aspidiotus rigidus reyne) outbreak populations in the Philippines. Insects. 2019;10(11):374. doi:10.3390/insects10110374
- Rachmadi AT, Kitajima M, Watanabe K, et al. Free-chlorine disinfection as a selection pressure on norovirus. Applied and Environmental Microbiology. 2018;84(13). doi:10.1128/aem.00244-18
- Serrana JM, Yaegashi S, Kondoh S, Li B, Robinson CT, Watanabe K. Ecological influence of sediment bypass tunnels on macroinvertebrates in dam-fragmented rivers by DNA metabarcoding. Scientific Reports. 2018;8(1). doi:10.1038/s41598-018-28624-2